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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抗体阳性鱼类特情人、寡核苷酸遮盖成本价高额或作业工艺流程有难度。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯专家教授技术团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个高产出预算、跨植物物种、全app平台兼容的全新解决方案。

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Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由国物理学技术分析院隔代显性基因与胸部发育动物制品学分析所和国隔代显性基因先学会牵头的新国际科研讨论中文核心杂志论文杂志期刊,秉承于新闻生活物理学技术分析和中医学隔代显性基因学方向的国内创新性分析成果。JGG 2028年度干扰分子式7.1,Scopus科研讨论中文核心杂志论文杂志期刊口碑公式CiteScore 9.9,名列JCR 2028年度GENETICS & HEREDITY方向Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY方向Q1区,名列国物理学技术分析院中文核心杂志论文杂志期刊区域动物制品学类别1区(Top中文核心杂志论文杂志期刊),隔代显性基因学和血生化与分子式动物制品学小类双1区。

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什么样的是HEATag

比较巧妙的“二合为一体”的设计

HEATag是由凝集素和HUH内切酶结构的就结合球蛋白

「位置器」控制器 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化装饰(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「对接器」模组 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)引索长形码展开共价相连接。

“1+1>2”的疗效:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行子样本标签与追溯。

Fig1: HEATag多沉符号操作过程提示图

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进阶篇考察

HEATag应该有大多能打?

能够 在有差异 具体条件下,实现目标哺乳期部分动物组织膜系单组织膜混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。分析技术团队为 HEATag 安装了多轮 “压检查”,从内部系到内部核,从常温下到温度低,从新鲜模板到固定好模板,全位子手机验证它的维持性和靠普性。

第一点轮测评而对喂母乳部分动物内部系:探讨工作员进行了基人、鼠、仓鼠两个外来植物种类的4类内部(HEK293T、K562、MEF、CHO),在温度下使用 HEATag 标示后混合型测序。最终能够回收公司的 11447 个内部中,85.66% 都能使用 HEATag 长形码准确度搭配到原外来植物种类,样本量间交叉式感染较少,UMAP 聚类研究分析法研究分析更多的是一直验证,HEATag 长形码与外来植物种类特喜欢的人基因遗传组共同点高不一。 一会儿,考试必要必备情况进三步晋升:设计技术人员试在 4℃下符号优质毛肚神经元核、在高温下符号甲醇紧固神经元核,以至于直接性符号神经元核核。结杲仍旧吸睛:各种必要必备情况下,模板标鉴与植物物种消息均更具良好 的关联性,分割准确度率超 95%。尽管甲醇紧固会影响经微的转录本相互污染源,神经元核核制取会起极富 RNA 因为流失,神经元核分类的批注结杲仍旧与优质毛肚模板保证各种不同,声明书 HEATag 可以符号各种不同处理必要必备情况下的实验报告模板。

Fig2: HEATag 可在其他前提下完工单细胞膜转录组混样探讨

才可以标志喂乳食草动植物和浮游生物无脊椎神经食草动植物的原代内部

若是说神经细胞系系试验是 “理论知识题”,那组织安排样版是 “增添题”, 等样版因此因神经细胞系形式简化、环保改变性非常规,当上标记图片水平的 “思路”,而 HEATag 正好在等 “思路” 上创造了好处。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸组织化,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞仅仅能被准确度区别,所有的基本血细胞的类型的聚类分析法结杲都明显可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海洋生物制品生物制品的适应性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长形码与种类转录组兼具较高同一性,未显示因高盐环保造成 的 “标注不可用”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可变现乳期甲壳动物公司样表多种 scRNA-seq 数据分析

Fig4: HEATag可保持优质浅海无脊椎骨昆虫多种 scRNA-seq 了解

HEATag与神经元的根据不可能致使转录组的同质性改动

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在成功标出钓鱼任务的的同时,没有对事件调查的转录多组分析致使干挠,切实保障了设计数据库的真人真事性。

Fig5: HEATag就不会反应样品的 RNA 表达出来方式

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未来的发展可期

HEATag 能为单组织细胞深入分析带来了哪个?

HEATag 的实际价值,远不断于 “克服标签的问题”,它的便捷性和普遍意义,也在为单人体细胞科研使用 非常多很有几率比

从主要用途设计一起来看

HEATag 能包括从 “简洁相对比较定量分析”(如癌公司与平常公司、药材补救与比)到 “大面积分析”(如公司组织细胞核图谱绘制图、mtk量意愿)的全区域意愿。时间推移 PIP-seq、Stereo-cell 等新型产品可初始化能力的转型,HEATag 还能进十步提高了单组织细胞核分析的通量,动力科学研究技术团队开设大面积的该项目。

从跨的领域潜质看到

HEATag 一方面采中用转录组学,还能与表观表观遗传组学、膳食纤维质组学、房间组学等技术工艺工艺紧密联系,进行设计数据库索引和寡核苷酸字段,HEATag 能能轻松自由融合有所差异的组学程序,不会影响数据采集强度。与此同时,应用场景HEATag还能能快速发展单受损细胞糖组学研究分析技术工艺工艺。

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合作项目各式各样

拜谱微生物与陈凯教学达到目标分步合作方式购房意向

什么值得点赞的是,在 HEATag 技巧水平水平展露出不可估量应运前景的底色下,拜谱生态学已与中国南方海洋资源微生物制品地理学与项目北京市检测室(北京)陈凯硕士生导师制定目标过程协议意想。甲乙双方记划贯穿 HEATag 技巧水平水平的财产化落实、科学的研究转化成等趋势做好长度通力合作,进一步推动上述低生产成本、跨动物群的单上皮细胞系核标签技巧水平水平最快应运于现实科学的研究动画场景,为其他检测室提拱高效率、城市发展的单上皮细胞系核的研究设备,帮助科学的研究的工作家在上皮细胞系核生态学学、海洋资源微生物制品生态学学、急病原则等前沿技术达到其他提升
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