
近日,苏州医科学校专业第1 附带医生王学浩工程院院士团队图片在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,淀粉酶互作组和靶向疗法人体脂肪基础代谢检测分析服务。
英文字母主题词:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
常常微信标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
业主的单位:南京医科大学
探析板材:细胞
拜谱提供了工作:转录组测序+球蛋白互作组+靶向药物卡路里产生组
技艺路线图:
深入分析后果
01、YBX1被鉴定结论为HCC中糖酵解的的关键基因组
本研发采集器HCC恶性淋巴癌症样表(n=7)的单团队RNA测序数据库库集开展解析,遇到糖酵解渗透性常见汇集在恶性淋巴癌症团队中,hdWGCNA解析面部识别出9个表观遗传模块图片(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的极限求生解析知道YBX1为自立极限求生可能性缘由(图1H)。进一部综合IHC、WB进行实验和恶性淋巴癌症团队与附近非恶性淋巴癌症团队的前景转录组学数据库库集灵魂存在YBX1是肝团队癌的治疗的隐藏的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被断定为可以调节HCC细胞核糖酵解的重点环境因素
02、YBX1促使HCC中的有氧糖酵解和增值能力
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点人体脂肪分泌组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1提高网站HCC中的有氧糖酵解和增值能力
03、OGT与YBX1结合起来并推动YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白质互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1结合在一起并有助于YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化推进其磷硝化作用,然而推进其核转位
进每这一步检则YBX1的O-GlcNAc糖基化可不可以干扰其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC神经元中或用OGT限注射剂OSMI-1加工除理,YBX1核球蛋白质平均层次同质性降底,YBX1磷硝化作用同质性减轻(图4A-C)。IP实践界面显示,在同等的Flag-YBX1底物平均层次下,YBX1-WT的磷硝化作用平均层次同质性低过YBX1-T57A,得出结论磷硝化作用的增添往往仅是因此较高的YBX1核球蛋白质描述(图4D)。提取了核和质混合物会会发现TMG加工除理的HCC神经元中YBX1核描述的增高(图4E-F),进每这一步会会发现YBX1磷硝化作用的要点调低成分是AKT(图4G-I)。这样会会发现关注O-GlcNAc糖基化能够 有助于会其磷硝化作用来资料YBX1核球蛋白质保持稳定义并有助于会核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 装饰语有益于其进两步情况磷酸性反应装饰语并能有助于其核转位
05、YBX1利于PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1带动PKM2转录
06、YBX1 要增加组蛋清乳过酸绘制技术
探索发现了YBX1敲低正相关降底蛋清质乳硝化成用,愈加是H3K18乳硝化成用(图6A-C)。糖酵解可抑药制剂2-DG的进行实验验证了糖酵解与组蛋清乳硝化成用的可以关系,可限制糖酵解可正相关降底H3K18la层次(图6D)。PKM2过表答方式不可逆转转YBX1敲低导致的的H3K18la骤降,之外源乳酸处里这不仅加快H3K18la,还伴有YBX1表答方式上涨,表示存在着正在向反馈意见(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR验证,H3K18la实现聚集于YBX1开机启动子可以提高网站其转录,该方式受O-GlcNAc糖基化政策调控(图6H-J),消息队列现了P300 上涨是YBX1减弱H3K18乳酰化成用的规则(图6K-L)。
图6.YBX1提高H3K18乳碱化掩盖水准
原创文章总结
在仅仅分析中有关报道了YBX1在HCC中高表现,如果与糖酵解秘切相关联。YBX1在T57处被O-GlcNAc突显,以此稳定可靠蛋清质并增大其表现。这突显还促进会会YBX1在T57处的磷碱化,促进会会其核易位。往往,这步骤明显增强了糖酵解相关联遗传染色体的转录并兴奋乳酸的产生了。前者,YBX1修改密码P300的转录,转而win7驱动组蛋清的乳碱化,很是H3K18la,H3K18乳碱化正方向干预YBX1遗传染色体转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传性正负极馈环体系图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱动物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向治疗能源分泌组技术服务,拜谱生物工程建立了完善成熟的转录组学、核蛋白组学、译员后体现组学、消化吸收组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
借鉴期刊论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.