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Microb Cell Fact | 遵义医科大学冯昆团队揭示无柄灵芝培养物产生灵芝酸的机制

发布时间：2024-07-25

三萜类化合物已呈现出广的生物学几丁质酶，涉及到抗淋巴肿瘤和抵抗疾病毒帮助。基本，三萜是依据甲羟戊酸行业制成的，并从天然冰绿色植物和白色念珠菌中抽取。遵义医科大学冯昆团队在Microb Cell Fact（IF=6.4）上发布了题写“Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile”的探究论文怎么写。该探究发掘三萜类化学物质野生灵芝粉酸（GA）是在粘液激发的无柄野生灵芝粉菌丝体中二萜15,16-二氢丹参酮I（DHT）的生物体工程图片转换会存在的。利用转录组和淀粉酶质组学高高技术进两步探讨无柄虫草菌丝体中DHT会存在2种虫草酸（GA）的制度化，并可根据多个学高高技术在线检测到的差异化性什么是基因和差异化性淀粉酶，推算DHT 生物体工程转化成 GA 的经由。拜谱生物提供了转录组测序和TMT定量蛋白质组学技术，为研究二萜生物转化为三萜提供了丰富的组学信息和候选基因。

文章名称：Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile（Microb Cell Fact，IF=6.4，2023.7）

客户单位：遵义医科大学

研究材料：无柄灵芝真菌菌丝体

拜谱提供技术：转录组测序、TMT定量蛋白质组学

研究结果

1.转录混合物析和功能键划分类别

可以通过对无柄野生灵芝白色念珠菌菌丝体进行转录组测序共能够得到67230个转录本和14296个单人类表观遗传。在哪些单人类表观遗传中，491个被监定为地域差异呈现出来人类表观遗传（DEGs），在这当中213个呈现出来上涨，279个呈现出来降低（图1A）。GO含有研究后，DEGs划分成海洋生物全时候（BP）、生殖神经元含量（CC）和团伙工作（MF）3类。在BP品目中，显现了前6个子品目：抗生素类分解的分解全时候，醋酸钠盐分解全时候和甲酸盐分解全时候;而在CC品目中，生殖神经元外区、突触复合型体、突触组成部分是前6个亚类。相对MF品目，甲酸脱氢酶（NAD）灵特异性、腐蚀重置酶灵特异性和酸氨（或酰胺）无线连接酶灵特异性是前6个亚品目（图1B）。在DEGs的KEGG环路研究中，前30条含有度最快的环路有27条归属于分解，在这当中甲烷气体分解、乙醛酸盐和二羧酸盐分解、丙酸盐分解预警环路可观含有（图1D）。

图1|转录酚类化合物析和效果归类

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

2. 蛋白质组定量分析和功能分类

根据对无柄灵芝粉真菌孢子菌丝体去营养素质组学具体定性定性深入介绍一下，总计有选定了16,457种独家肽、2606种营养素质和2588种参考值营养素质。在阈值法|FC|>1.2和p<0.05的选择标准下，你不在2606种营养素质中，94种被鉴别为文化不一致性表明营养素（DEPs），进来52种上涨，42种调低（图2A），图2C彰显了文化不一致性表明营养素的聚类算法具体定性定性深入介绍一下热图。从GO具体定性定性深入介绍一下看你，BP专业类别彰显，大部分是数DEPs参与性乙酸盐細胞产生整个环节、消炎药转换細胞产生整个环节和肿瘤药物转换細胞产生整个环节。CC类DEPs在細胞外区、过脱色物酶体和微体中比倒最低，脱色呈现酶渗透性和甲酸脱氢酶（NAD）渗透性在MF类中DEPs的比倒最低（图2B）。与转录组最终结果类似的，KEGG径路具体定性定性深入介绍一下彰显，大量DEPs在細胞产生中怪物丰度，进来3条最怪物丰度的经由是光合怪物中的碳固定住、碳細胞产生和MAPK信号灯径路（图2D）。除此之外，根据具体定性定性深入介绍一下GO数据统计库的CC对DEPs去亚細胞品牌定位具体定性定性深入介绍一下和参考文献标注（图2E），DEPs主耍分布点在細胞质（40.66%）、細胞膜（17.58%）、线粒体（12.09%）和内质网（8.79%），按理来说上是GAs怪物转化成的主耍区域。

图2|血清质组的定量介绍介绍和功效确认

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

3.转录组和蛋白质组数据相关性分析，RT-qPCR验证

糊口物被转化和對照组获选DEGs和DEPs做了维恩图，有20个差异化表示dna组（图3A）。对转录组和淀粉酶酶酶质组中E组和C组总共有的DEGs/DEPs对其进行聚类研究一下研究一下，挖掘mRNA和淀粉酶酶酶质彼此有19个调涨dna组和9个降低dna组，DEGs和它的反译的DEPs表示关卡呈正一些，立于Pearson的一些公式研究一下，在转录组和淀粉酶酶酶质组彼此的检测到相对来说较高的一些性（R = 0.87）（图3C）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）检验成果屏幕上显示，E组和C组19个DEGs的理解平均水平不不对性有明显，但其中9个为调整DEGs，5个为上涨DEGs（图3D）。DEGs在RT-qPCR中的理解市场趋势与转录多组分析成果不对。

图3|蛋清质组的按量研究分析和功效认证

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

拜谱小结

综上所述，该研究结果为真菌对天然产物的生物转化提供了新的见解，这将有助于开发更有效、更经济的方法，以方便的方式获得稀有的三萜。拜谱生物提供了转录组测序、TMT定量蛋白质组学转录组学技术，拜谱生物可提供完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系。此外，拜谱生物推出的中药代谢组整体解决方案，基于更丰富、更专业的中药数据库，更高的数据质量、更优质的服务，可进行中药成分分析、中药入血/组织分析、网络药理学等分析，助力客户探索中药前言研究，欢迎致电咨询！

参考文献：Wang X, Wu H, Wong KH, Wang Y, Chen B, Feng K. Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile. Microb Cell Fact. 2023 Jul 28;22(1):139. doi: 10.1186/s12934-023-02156-5.

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