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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

始终看做热工业原料而被耳熟能详的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“消化吸收废品”拥有“产品小分子结构”的心路经历经历是类似的,等到近二十多年才被找到其非常重要的生物制品学功效,终究“翻盘农奴把大合唱”,特殊是在免疫力慢性炎症病变性传染疾患探析行业领域内与时共进。有数篇毕业论文通讯报道了在繁多慢性炎症病变性传染疾患的节肢动物绘图中寄予衣康酸或其电学修饰语延伸物制品的方法益处,并找到其意向靶点。至于衣康酸的“上一世”与“今身”,详细文案《乳酸的逆转兄弟们——衣康酸!本文和你一起理解衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应表达蛋清组学产品,实现1000+深奥度遮盖位点检测,比较稳定显现经典爱情靶点,全座向生信深入分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“表明”到“查验”全方法产品,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、科学试验工艺流程

02、测试的数据的数据

03、经“点”初现

在测评数据库中,查出多条文献资料中报导的传统靶点举例衣康酸绘制位点,如一、个被发展的衣康酸共价绘制蛋白质质质KEAP1,都有糖酵解通道中的3个主要酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,、炎性小体成分蛋白质质质NLRP3和组织细胞细胞坏死的过程中的主要蛋白质质质RIPK3等,其质谱图如下图提示图提示。

04、产品设备特色

1.很多质控

工业化活性聊天监测工具器孵育、SDS-PAGE监测工具、WB验正、样品相应的性分析一下等一定要多方面位监测工具,提高认识产品没想到准确性性。

2.高效果质谱实验室设备的平台

在Orbitrap Astral全新第三代高粪便质谱仪支持下,达成衣康硝化作用遮盖位点及淀粉酶鉴别新厚度,助推器合理的研究新察觉。

3.全注意事项一走式的服务

由于拜谱生物技术全面的试验网站,可打造“神经元养育→电极孵育→WB检验→玄妙度衣康硝化作用体现检验→专属密码生信定性分析→其他位点PRM核实”全步奏服务培训,省时省时省力更放心。

05、解析项目(一些)

06、应用路径

PART 2、论文参考文献分享赚钱

论文一

日语网站标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

中文字幕题目:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

科学研究文章:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

期刊论文二

英文版标题文字:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

中文名一级标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

实验资源:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、范例衍生品工作思路

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13有极强的底物根据学习能力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物工程衣康过酸淡化组实际数据显示中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康过酸绘制(如下所述图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱个人总结

是TCA循环往复中的间新陈基础代谢率物,衣康酸上下调整新陈基础代谢率、天然免疫力性和肠道疾患相互之间间的相互之间影响到,为的的治疗天然免疫力性肠道疾患性肠道疾患具备了代用的的治疗要点。衣康酸型式特征中的亲电性α,β-不过饱和羧酸型式特征能对核球氨基酸含量上的活性酶类半胱氨酸残基进行烷基化表达语(迈克尔增益不起作用),相应翻泽后表达语被又称“衣康酸表达语(itaconation)”,接着影响到核球氨基酸含量功用,调节作用天然免疫力性回复和新陈基础代谢率经过,为很多种肠道疾患制剂开发具备新要点。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸装饰血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学专业任何时候参考值靶点分解代谢组(QMT1000)或体力分解靶向疗法分解组物料对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

考生专著

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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